分子蒸餾系統是一種在高真空下操作的蒸餾方法。此時，蒸氣分子的平均自由度大于蒸發面與冷凝面之間的距離，因此可以通過材料和液體組分的蒸發速率的差異來分離液體混合物。

　　分子蒸餾裝置系統是一種特殊的液體分離技術，它有別于傳統的蒸餾分離原理，而是通過不同物質分子運動平均自由程的差異來實現分離。

　　隨著液體混合物沿加熱板流動和加熱，重分子從液體表面逸出并進入氣相。由于重分子的自由范圍不同，不同物質的分子從液面逸出后的移動距離也不同。如果冷凝板設置得當，輕分子會到達冷凝板排出，而重分子則達不到冷凝板沿混合物排出的目的。這樣，達到了物料分離的目的。沸騰膜與冷凝面之間的壓力差是蒸汽流動的驅動力，很小的壓降就會使蒸汽流動。沸騰面和冷凝面之間的距離為1 mbar。基于此原理的蒸餾器稱為短路徑蒸餾器。短程蒸餾器(分子蒸餾)在加熱對面有一個內置冷凝器，將工作壓力降低到0.001 mbar。

　　分子蒸餾系統由外加熱的立式圓筒、中心的冷凝器和在蒸餾器和冷凝器之間旋轉的刮板組成。

　　蒸餾過程是：物料從蒸發器頂部加入，通過轉子上的液體分配器連續均勻地分布在受熱面上，然后刮板將液體刮成非常薄的、湍流的液膜，呈螺旋狀向下旋轉。在此過程中，從受熱面逸出的輕分子通過短路和內置冷凝器幾乎不發生碰撞凝結成液體，順著冷凝管流下，通過蒸發器底部的出口管排出。;加熱區下方圓圈內的殘留液體重分子被收集在異形通道中，然后通過側出口管流出。

　　分子蒸餾裝置的幾個特點。

　　1、蒸餾溫度低。分子蒸餾分離利用分子平均自由度的差異，使蒸餾溫度遠低于原料的沸點，解決了高附加值化學品的熱敏感性問題。

　　2、高真空蒸餾。創造高真空系統環境的一個重要因素是良好的密封性，內部壓力可以降低到0.1Pa以下。

　　3、分離效率高。由于其不可逆性，分子蒸餾過程可以分離普通蒸餾中不可分割的物質。這一特點使分子蒸餾技術適用于對產品純度要求較高的食品和制藥領域。

　　4、物料加熱時間短。分子蒸餾裝置的刮板在蒸發器表面形成均勻的薄膜，增加了蒸發面積，縮短了蒸餾時間，降低了物料長期受熱分解的概率，節省了時間和成本。